Na teren nowej siedziby przeniosły się: wszystkie kliniki (Kliniki Chorób Wewnętrznych, Klinika Hematologii, Klinika Chirurgii, Klinika Transplantacji, Oddział Leczenia Dziennego), wszystkie poradnie specjalistyczne, ZTiOSK, RTG/USG, wiekszość zakładów naukowych oraz jednostki administracyjne (Dyrekcja, Dział Obslugi Lecznictwa, Dział Techniczny, Dział Kadr i Płace, Dział Zaopatrzenia i Zamówień Publicznych, Dział Finansowo - Księgowy, Dział Planowania Naukowego). Na terenie nowej siedziby na Ursynowie została uruchomiona izba przyjęć.
Na starej siedzibie (Warszawa Chocimska 5) pozostały: Apteka, Zakład Biochemii, Zakład Immunologii Hematologicznej i Transfuzjologicznej, Rejestr Niespokrewnionych Dawców Szpiku, Samodzielna Pracownia Porfirii, Pracownia Mikrobiologii, Biblioteka Naukowa, Magazyn Gospodarczy, Inspektorzy BHP i PPOŻ, lekarz zakładowy.