Od 1993 roku Instytut jest ośrodkiem referencyjnym Światowej Organizacji Zdrowia w dziedzinie gruźlicy.
PRZYCHODNIA PRZYKLINICZNA
I KLINIKA CHORÓB PŁUC
II KLINIKA CHORÓB PŁUC
III KLINIKA CHORÓB PŁUC
KLINIKA CHIRURGII
KLINIKA CHORÓB WEWNĘTRZNYCH
KLATKI PIERSIOWEJ
ODDZIAŁ ANESTEZJOLOGII I INTENSYWNEJ TERAPII
INTENSYWNA TERAPIA PNEUMONOLOGICZNO- KARDIOLOGICZNA (SALA R)
ZAKŁAD DIAGNOSTYKI LABORATORYJNEJ
ZAKŁAD DIAGNOSTYKI I LECZENIA NIEWYDOLNOŚCI ODDYCHANIA
ZAKŁAD EPIDEMIOLOGII I ORGANIZACJI WALKI Z GRUŹLICĄ
ZAKŁAD FIZJOPATOLOGII
ZAKŁAD MIKROBIOLOGII
ZAKŁAD PATOMORFOLOGII
ZAKŁAD RADIOLOGII
SAMODZIELNA PRACOWNIA DIAGNOSTYKI MOLEKULARNEJ
SAMODZIELNA PRACOWNIA REHABILITACJI